Đại học Tsukuba thông báo từ tháng 4 năm 2026 sẽ tăng phí ký túc xá ở 17 hạng mục, mức tăng từ 1,27 lần đến 2,1 lần; ví dụ, phòng đơn sẽ có giá 39.810 yên/tháng, phòng cho du học ngắn hạn 92.750 yên/tháng. Lý do gồm chi phí duy trì và tiện ích tăng, xuống cấp cơ sở và cập nhật thiết bị như máy lạnh. Nhiều sinh viên cho biết họ không nhận được bảng chi tiết khiến họ bối rối. Hiệu trưởng Kyousuke Nagata cho biết lạm phát khiến trường thâm hụt vài tỷ yên mỗi năm và sẽ tổ chức các buổi giải thích nội bộ. Trường cũng đặt mục tiêu đến cuối năm tài khóa 27 đạt tỷ lệ sinh viên mới ở ký túc xá là 80%. Từ năm tài khóa 27, học phí của du học sinh nước ngoài cũng tăng: học phí hàng năm 535.800 yên, cộng thêm 73.000 yên mỗi năm cho sinh viên chính quy hoặc 36.000 yên cho sinh viên không chính quy. Trường cho biết mức tăng này dành cho chi phí liên quan khóa học tiếng Nhật và hỗ trợ visa. Số lượng du học sinh ngày càng tăng và có thể có thêm mức tăng trong tương lai.